En 1924, Michel est ordonné lecteur par le métropolite Antoine Khrapovitsky, son père spirituel. Ses études de théologie terminées, il sera tonsuré moine le 28 juin 1926, sous le nom de Jean, au monastère Milkovo (Miljkov Manastir), situé au sud de Belgrade, où six moines émigrés de Russie venaient d’arriver avec à leur tête le hiéromoine Ambroise Kurganov, qui selon la chronique « attirait à Milkovo, tel un aimant, les meilleurs moines russes de l’émigration ».
Le nom monastique de Jean lui fut donné en l’honneur de son parent éloigné : Saint Jean de Tobolsk (en Sibérie), – dont il avait été métropolite au XVI°-XVII° siècle. Ce dernier avait écrit un ouvrage intitulé « Heliotropion », c’est à dire « Fleur de tournesol », un titre d’allure bucolique qui s’explique par son sous-titre : « Comment conformer ou accorder la volonté humaine avec la volonté divine ».
